基于SVM方法的大腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測——張鈺 劉頌 胡珊等

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          基于SVM方法的大腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測——張鈺 劉頌 胡珊等
          資源大小:133.17 KB 資源類型:文檔
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          資源介紹
          基于SVM方法的大腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測
          張鈺① 劉頌① 胡珊① 丁培榮②
          ①中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系,510080,廣州市中山二路74 號
          ②中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院結(jié)直腸科,510060,廣州市東山區(qū)東風(fēng)東路651 號
          摘 要 本文收集了1000 多例大腸癌病人的臨床數(shù)據(jù),運用支持向量機的算法對病人淋巴
          結(jié)是否轉(zhuǎn)移進行分類預(yù)測,用交叉驗證的的方法得出最佳參數(shù),預(yù)測準(zhǔn)確率為82.65%.
          關(guān)鍵詞 支持向量機 數(shù)據(jù)挖掘 交叉驗證
          1 引言
          淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是影響大腸癌預(yù)后最重要的因素之一,因此準(zhǔn)確地判斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)
          移與否對于判斷預(yù)后、制定治療方案意義重大[1]。目前診斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的“金標(biāo)
          準(zhǔn)”是病理組織學(xué)檢查,然而它會受到一些因素的影響,如淋巴清掃范圍、取檢
          淋巴結(jié)的方法、淋巴結(jié)微轉(zhuǎn)移的客觀存在等。事實上,一些病理分期為早期的病
          人出現(xiàn)了預(yù)后差的情況,可能與我們沒有發(fā)現(xiàn)存在的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶有關(guān)。
          本文嘗試建立淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測的計算機模型,能夠為臨床手術(shù)方案的制
          定提供一定的參考依據(jù)。共收集了中山大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院一千多例結(jié)直腸
          癌病人的數(shù)據(jù),在對數(shù)據(jù)進行凈化、去噪聲、離散化等預(yù)處理后,利用支持向
          量機軟件libsvm(臺灣大學(xué)林智仁副教授等研發(fā))對大腸癌N 分期進行預(yù)測。
          2 基本原理
          支持向量機(SVM)是一種新型的機器學(xué)習(xí)方法,它是建立在統(tǒng)計學(xué)習(xí)理論
          的vc(Vapnik Chervonenks)維理論和結(jié)構(gòu)風(fēng)險最小化(Structural RiskMinimi
          zation,SRM)原理基礎(chǔ)上的,即是由有限訓(xùn)練樣本得到的決策規(guī)則對獨立的測試
          集仍能得到小的誤差,這使得 SVM 方法 比基于經(jīng)驗風(fēng)險最小化(Empirical Ri
          sk Minimization,E1)的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)ANN 等方法具有更好的泛化能力和分類精
          確性。支持向量機能較好地解決小樣本、非線性、高維數(shù)和局部極小點等實際問
          題,目前已成為機器學(xué)習(xí)界研究的熱點。雖然 SVM 方法在理論上具有突出的優(yōu)
          勢,但應(yīng)用研究相對于理論研究較為滯后。SVM 的基本思想是對于非線性可分樣
          本 ,將其輸入向量通過非線性變換映射到另一個高維空間,使其線性可分,在
          這個新空間中尋找一個最優(yōu)分類超平面,使得超平面與不同類樣本集之間的距離
          最大,從而達到最大的泛化能力。SVM 的這種非線性變換是通過核函數(shù)計算高維
          空間中的內(nèi)積實現(xiàn)的,這樣就避免了維數(shù)升高而引起的計算困難[2],其基本原理
          如下:考慮一個線性可分的二分類問題,設(shè)線性可分的個訓(xùn)練樣本集{( , ),
          i:1,2,…l,},輸入樣本空間的維數(shù)為d,每個樣本屬于標(biāo)記為 ∈{-1,
          1}的兩類之一。由這一組樣本可以確定一個分類超平面,使得離它
          最近的每類點(稱為支持向量)與它的距離達到最大值,對于每個樣本有 :
          ≥ 1 (1)
          樣本到超平面的距離,即分類間隔,可定義為,當(dāng)最小時,分類間隔最
          大,此時的分離超平面即為最優(yōu)分類面。使分類間隔最大實際上就是對推廣能力
          的控制,統(tǒng)計學(xué)理論表明[3]最優(yōu)分類面具有最好的推廣能力。
          考慮到訓(xùn)練樣本集為線性不可分時,需引入非負(fù)松弛變量,i=1,2,…,l,
          上述最優(yōu)超平面的求解問題為:
          (2)
          其中,懲罰參數(shù)C>0,C 越大表示對錯誤分類的懲罰越大。式(2)中第一項
          使分類間隔盡量大,第二項則使誤差盡量小
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